E' un organo consultivo della Fondazione ed ha il compito di promuovere ogni attività volta a garantire l'indirizzo scientifico della Fondazione nel rispetto della storica vocazione giuridico - forense del Castello quale luogo di studi e di dibattiti giuridico - culturali; a tal fine esprime parere obbligatorio sulle delibere del Consiglio di Amministrazione e del Comitato Esecutivo relative alle attività di carattere scientifico e culturale. 
E' composto inizialmente dai soggetti nominati nell'atto costitutivo. Potrà inoltre essere aumentato con delibera del Consiglio di Amministrazione, su proposta del Presidente, con membri scelti tra persone particolarmente qualificate, di riconosciuto prestigio del mondo istituzionale, accademico e professionale, di riconosciuta professionalità nei settori in cui opera la Fondazione. 
Il Presidente del Comitato Scientifico partecipa, senza diritto di voto, alle riunioni del Consiglio di Amministrazione e del Comitato Esecutivo. Può farsi sostituire, in caso di impedimento, dal Vicario da lui nominato. 
Il Presidente cura la formazione del regolamento per il funzionamento del Comitato Scientifico. 
Il Comitato Scientifico è composto dai signori:
- Presidente del Comitato Scientifico
 dott. Antonio Buonajuto
 Presidente della Corte di Appello di Napoli
- dott. Carlo Alemi
 Presidente del Tribunale di Napoli
- avv. Giuseppe Abbamonte 
 Consiglio dell'Ordien degli Avvocati di Napoli
- prof. Franco Amarelli 
 Ordinario di Diritto Romano dell'Università Federico II di Napoli
- notaio Maria Claudia Andrini 
- dott. Gregorio Angelini 
 Direttore Regionale Beni Culturali e Paesaggistici della Campania
- dott.ssa Giuseppina Casella 
 rappresentante pro - tempore locale nominata al C.S.M.
- avv. Michele Cerabona 
 Consiglio dell'Ordine degli Avvocati di Napoli
- dott. Giovanni Colangelo 
 Procuratore della Repubblica di Napoli
- dott. Aldo De Chiara 
 Procuratore Aggiunto della Procura della Repubblica di Napoli
- avv. Massimo Di Lauro 
 Consiglio dell'Ordine degli Avvocati di Napoli
- dott. Luigi Di Mauro 
 Direttore Generale
 Ministero della Giustizia
- dott. Carminantonio Esposito 
 Presidente del Tribunale di Sorveglianza
- dott. Antonio Guida 
 Presidente del TAR Campania
- prof. Giancarlo Laurini 
 Presidente della Fondazione Italiana del Notariato
- dott. Ottavio Lucarelli 
 Presidente del Consiglio dell'Ordine dei Giornalisti della Campania
- dott. Vittorio Martusciello 
 Procuratore Generale Reggente presso la Corte di Appello di Napoli
- dott. Alessandro Pepe 
 Rappresentante pro - tempore locale al C.S.M.
- avv. Andrea Pisani Massamormile 
 Consiglio dell'Ordine degli Avvocati di Napoli
- avv. Luigi Mastrominico 
 Avvocato Generale
- arch. Amalia Scielzo 
 Sovrintendenza per i Beni architettonici, paesaggistici,
 storici, artistici ed etnoantropologici
 per Napoli e provincia
- prof. Michele Scudiero
- avv. Vincenzo Siniscalchi 
 Consiglio dell'Ordine degli Avvocati di Napoli
- dott. Francesco Valentini 
 Presidente della Giunta di Napoli dell'Associazione Nazionale Magistrati
- dott. Carlo Visconti 
 Segretario Generale C.S.M.